Conformément à l’article 15 de la CDB, le Protocole de Nagoya précise tous les contours du partage juste et équitable des avantages découlant de l’utilisation des ressources génétiques. L’objectif du Protocole de Nagoya sur l’Accès aux ressources génétiques et le Partage juste et équitable des Avantages (PN/APA) est de faire en sorte que ceux qui accèdent aux ressources génétiques (les firmes, les chercheurs, etc.) partagent les avantages monétaires (redevances) et non monétaires (développement des capacités, appui en matériel de recherche, etc.) qu’ils tirent de l’utilisation de telles ressources avec les pays d’origine et les communautés locales de ces pays.

Le Burundi a adhéré au Protocole de Nagoya suivant la loi N°1/21 du 23 Juin 2014. Avec cette adhésion, le Gouvernement burundais à travers le Ministère de l’Eau, de l’Environnement, de l’Aménagement du Territoire et de l’Urbanisme (Actuel Ministère de l'Environnement, de l'Agriculture et de l'Elevage) prend toutes les dispositions utiles et nécessaires pour garantir la mise en œuvre du protocole au Burundi.

Pour mettre en œuvre ce protocole, il doit définir son cadre national qui lui est propre notamment par l’adoption des mesures législatives, administratives ou en matière de politique publique claire pour régir l’accès aux ressources relevant de leur autorité. C’est dans ce cadre qu'il s'est doté d’une Stratégie Nationale et Plan d’Action sur l’APA qui  sert d’orientation stratégique pour toutes les interventions qui sont menées en matière d’APA. Cette stratégie nationale a comme vision nationale «D’ici à 2020, l’accès aux ressources génétiques et connaissances traditionnelles y associées est accordé moyennant un partage juste et équitable des avantages en découlant en faveur des bénéficiaires essentiellement les communautés locales et autochtones et en garantissant des avantages essentiels pour les générations actuelles et futures».

Pour opérationnaliser cette vision, il importe pour le Burundi de définir un cadre légal clair et stable qui soit de nature à contribuer au partage juste et équitable des avantages découlant de l’utilisation des ressources génétiques et à l’éradication de la pauvreté, tout en augmentant les possibilités d’activités de recherche et de développement axées sur la nature.

Le Protocole de Nagoya précise quels aspects les Etats doivent considérer lorsqu’ils élaborent leur législation sur l’APA, notamment les conditions portant sur les droits d’accès, l’utilisation éventuelle des ressources, la participation des nationaux dans la réalisation du projet de recherche, le transfert du savoir-faire et de l’équipement, le partage éventuel des bénéfices découlant de l’utilisation commerciale des ressources en question et l’obtention de technologies nouvelles. La situation de vide juridique dans ce domaine favorise l’utilisation frauduleuse des ressources génétiques et des connaissances traditionnelles associées (la biopiraterie) et ne profite pas au Burundi de la ressource génétique et pourrait à long terme conduire à la perte de ses ressources biologiques.

C’est donc dans ce cadre que ce projet de décret est élaboré pour combler le vide juridique et contrecarrer l’utilisation frauduleuse des ressources génétiques et des connaissances traditionnelles y associées et ainsi pouvoir mettre en œuvre les dispositions du Protocole de Nagoya. Il a pour objetif de favoriser la mise en œuvre des dispositions de la Convention sur la diversité biologique et du Protocole de Nagoya en rapport avec l’accès aux ressources génétiques et aux connaissances traditionnelles y associées, ainsi que le partage juste et équitable des avantages découlant de leur utilisation.